计算化学公社

标题: 将.fchk转为.molden用IBOview打开报错 [打印本页]

作者
Author: 火星哥 时间: 2023-12-29 11:19
标题: 将.fchk转为.molden用IBOview打开报错
LoadOrbitalFile failed: *ERROR while loading file 'C:/Users/Administrator/Desktop/IRC-TS-INT3-NL-5.molden':Unexpected format: 'expected '[Molden Format]'
请问该问题如何解决，是否一定需要用ORCA？

作者
Author: Alchemistzyl 时间: 2025-4-25 16:08
如图所示

作者
Author: zhdeng 时间: 2025-12-12 02:27

Alchemistzyl 发表于 2025-4-25 16:08
如图所示

试过了，不行的

作者
Author: sobereva 时间: 2025-12-12 02:35

zhdeng 发表于 2025-12-12 02:27
试过了，不行的

2L的做法完全不对，网页里胡写
Gaussian根本没法直接产生molden文件

用Multiwfn载入fchk等任意其支持的波函数文件，主功能100的子功能2导出molden文件，根本不需要任何折腾。这是最简单方法，没有之一

作者
Author: beefly 时间: 2025-12-12 20:17
IBOview读取的molden文件必须是unix换行符。用dos2unix、ultraedit等工具转化一下就可以了

作者
Author: 火星哥 时间: 2025-12-12 21:16

beefly 发表于 2025-12-12 20:17
IBOview读取的molden文件必须是unix换行符。用dos2unix、ultraedit等工具转化一下就可以了

好的
谢谢您

作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ 时间: 2025-12-12 21:58
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2025-12-13 00:16 编辑

补充几个细节：
1. 至今Gaussian的程序设计就确实没有把波函数信息按molden文件格式输出的功能；
2. IboView网页Picture Guide To IboView中最后一点"See also: {link} for additional comments on getting .molden files from Gaussian."链接的原始网页已无法访问，网页时光机找到的存档开头是这么写的：

Using Molden with GAUSSIAN
* When using Molden with GAUSSIAN 94/98/03 the following keywords are required on the GAUSSIAN 94/98/03 inputfile:
#P GFINPUT IOP(6/7=3)
#P switches on printing of SCF convergence, GFINPUT switches on printing of Basis Set info, and IOP(6/7=3) switches on printing of all MO's.

注意Molden虽然现在常指代一种波函数信息的文件格式，但原先是指定义该文件格式的一个上古可视化软件。我估计Molden软件可以加载写了这些关键词的Gaussian输出文件并读到波函数信息，这也是Using Molden with GAUSSIAN页面原作者解释的Molden软件与Gaussian联用的做法；然而IBOview的作者理解出了偏差，误以为这些关键词能从Gaussian导出molden文件。
3. 截至目前的v20211019-RevA版本，可以验证IboView并不能加载Gaussian输出文件，更无法从中读取波函数信息。
4. 抽象的IOp(6/7=3)实际上就是关键词pop=full，要求打印所有分子轨道的展开系数及密度矩阵，结合gfinput要求打印的基组定义确实可以让Gaussian输出文件像ORCA和GAMESS-US输出文件那样带着波函数信息，代价当然是让输出文件冗长而庞大，而且现在没有什么刚需的可视化软件会从Gaussian输出文件读波函数信息。
5. orca_2mkl输出的molden文件不是标准格式，但是Multiwfn、IboView、一代Avogadro等若干软件都有特定处理机制使得波函数信息正确读取，这点在ORCA论坛讨论过（https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=11599）；而社长的multiwfn，以及5楼老师的Molden2AIM，转换出的molden文件应该是标准的。

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