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标题: 计算回转半径时如何选择合适的组？ [打印本页]

作者
Author: moni0823 时间: 2023-12-29 15:54
标题: 计算回转半径时如何选择合适的组？
本帖最后由 moni0823 于 2023-12-29 15:57 编辑

各位老师同学好，请教大家一个问题，我在计算一个体系中蛋白质的回转半径的时候，使用gyrate命令时，在选择组的时候，应该如何去选择，我在此之前一直选择的都是protein组，我想问一下这些组有什么区别吗？比如说protein和backbone一般会在什么情况下选择？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-12-30 08:37
显然差别在于是否考虑侧链部分
通常差异不大，只不过横向对比的时候必须统一

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