计算化学公社

标题: 搜索有机物在激发态水解的过渡态，激发态自由能计算问题 [打印本页]

作者
Author: Sui1999 时间: 2024-1-2 09:34
标题: 搜索有机物在激发态水解的过渡态，激发态自由能计算问题
各位老师好，我在搜索有机物在激发态水解的过渡态，反应路径如下，首先发生CO键的断裂生成P1，随后和水反应生成P2，最后再和第二个水反应生成P3。
想问一下计算反应路径上从初始反应物到P1之间的吉布斯自由能可以使用有机物在S1的吉布森自由能加上两个S0的水的吉布森自由能吗？
类似的P1到P2直接的能量可以用中间产物的S1吉布斯自由能加上一个S0的水的吉布斯自由能吗？
尝试过将水放在距离有机物60 Ångstrom的位置，但是算出来的结构一直有虚频，消了一周了还没消掉，所以来问一下这种激发态的反应路径，在计算吉布斯自由能的时候分成两个文件来算是否合适。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-3 03:33
“水放在距离有机物60 Ångstrom的位置” 这是不可思议的事情，离那么远有什么意义？还怎么反应？

作者
Author: Sui1999 时间: 2024-1-3 08:49

sobereva 发表于 2024-1-3 03:33
“水放在距离有机物60 Ångstrom的位置” 这是不可思议的事情，离那么远有什么意义？还怎么反应？

老师您好，我的反应是这样的，整个反应路径上需要和两个水分子反应，为了保证整个体系的电子数目一样，所以在计算前面的吉布斯自由能的时候加了一到两个水分子，放到这么远是为了尽可能降低水分子的电子和当前反应体系的电子之间的相互作用。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-3 09:00

Sui1999 发表于 2024-1-3 08:49
老师您好，我的反应是这样的，整个反应路径上需要和两个水分子反应，为了保证整个体系的电子数目一样，所 ...

显然应该分开独立计算，哪能这么搞。而且你这么算的话，得到的平动、转动对热力学量的贡献也是不合理的

作者
Author: Sui1999 时间: 2024-1-3 09:04

sobereva 发表于 2024-1-3 09:00
显然应该分开独立计算，哪能这么搞。而且你这么算的话，得到的平动、转动对热力学量的贡献也是不合理的

好的谢谢老师，我之前看到过老师在其他帖子说过基态的反应可以分开算，但是我不确定激发态的可不可以，所以来问一下，非常感谢老师。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)