计算化学公社

标题: 求助:VMD如何仅显示硫化氢和水之间的氢键 [打印本页]

作者
Author:
origami    时间: 2024-1-2 22:31
标题: 求助:VMD如何仅显示硫化氢和水之间的氢键
各位老师好,我的体系包含水、甲烷和硫化氢,想在VMD中通过"Draw Method- HBonds" 仅显示出硫化氢和水之间的氢键,但尝试了多种选择语句都无法得到想要的结果。图1-2给出了我的选择语句设置以及可供选择的内容。此外,关于硫化氢和水之间氢键存在问题,已使用 "VMD- extension- hydrogen bonds" 设置确定了其存在以及数量,如图3-4所示。希望各位老师能给一些建议,谢谢。

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作者
Author:
sobereva    时间: 2024-1-3 02:01
没法靠选择语句实现,不可避免会把硫化氢之间以及水之间的氢键一起展现
唯一能实现的是自己写VMD脚本,用作图命令来绘制
作者
Author:
origami    时间: 2024-1-3 11:03
sobereva 发表于 2024-1-3 02:01
没法靠选择语句实现,不可避免会把硫化氢之间以及水之间的氢键一起展现
唯一能实现的是自己写VMD脚本,用 ...

好的,谢谢卢老师啦




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