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标题: 关于GROMACS版本的问题 [打印本页]

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wmy1217    时间: 2024-1-3 10:47
标题: 关于GROMACS版本的问题
有个小问题想请教一下大家,就是我的分子动力学模拟一直是用自己的电脑跑,跑的是蛋白和配体小分子,就是之前sob老师编译好的windows版本的2020.6 CUDA GPU的GROMACS,但是最近学校新开通了超算平台,版本是2021.5,无GPU,我想在保留之前的运算结果下使用这个超算平台的数据,请问可行吗?

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jackshoulder    时间: 2024-1-3 17:01
如果你自己的电脑上跑完了,想用自己电脑上的数据进行续跑,应该是可以的,高版本可以兼容低版本的轨迹,我之前试过,但是高版本能不能兼容低版本的轨迹就不知道了,你可以尝试,这种事情,不要害怕,直接尝试
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sobereva    时间: 2024-1-4 09:56
不同版本gmx的轨迹可以相互兼容
注意新版本mdrun可以跑旧版本grompp产生的tpr,反过来不行




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