计算化学公社

标题: 求助AIM键径分析时发现氢键的键径偏移了，该怎么解决或怎么解释 [打印本页]

作者
Author: ktylea 时间: 2024-1-4 11:50
标题: 求助AIM键径分析时发现氢键的键径偏移了，该怎么解决或怎么解释
B3LYP 6-311G*优化的结构转FCHK文件，Multiwfn在进行AIM键径分析时，结构中18 (O) - 16 (H) 应该像17 (O）- 4 (H) 位置一样出现氢键键径，结果显示18 (O) - 11 (O)键径，这种结果该怎么解决，求大神指导!

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-4 12:26
没什么异常，本来从拓扑关系上，两个(3,-1)彼此之间就能直接相连

这种体系强烈建议用IRI可视化展现相互作用，比靠AIM拓扑分析能展现的直观充分得多
使用IRI方法图形化考察化学体系中的化学键和弱相互作用
http://sobereva.com/598（http://bbs.keinsci.com/thread-23457-1-1.html）

作者
Author: ktylea 时间: 2024-1-4 14:56
好的，大神！感谢回复

作者
Author: ktylea 时间: 2024-1-4 15:03

sobereva 发表于 2024-1-4 12:26
没什么异常，本来从拓扑关系上，两个(3,-1)彼此之间就能直接相连

这种体系强烈建议用IRI可视化展现相互 ...

大神，目前AIM键径O18 -H16，这种情况下，如果采用透彻认识氢键本质文章中的公式，进行氢键键能的描述，BCP的数据可以用吗

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-5 10:16

ktylea 发表于 2024-1-4 15:03
大神，目前AIM键径O18 -H16，这种情况下，如果采用透彻认识氢键本质文章中的公式，进行氢键键能的描述，B ...

太牵强。此氢键键角太大，都不算一般的氢键

作者
Author: ktylea 时间: 2024-1-6 19:14

sobereva 发表于 2024-1-5 10:16
太牵强。此氢键键角太大，都不算一般的氢键

感谢大神，回答！

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