计算化学公社

标题: 如何对蛋白质pdb文件进行乙酰化处理 [打印本页]

作者
Author: 邹惠珍 时间: 2024-1-5 17:05
标题: 如何对蛋白质pdb文件进行乙酰化处理
我准备对一个蛋白质中某一丝氨酸进行乙酰化处理后跑md，请问有amber能进行此类处理吗？如果不能或许有什么软件能完成这类处理。

作者
Author: CAOPEIFANG 时间: 2024-1-18 10:10
同求助，请问你解决了吗

作者
Author: SiqiLee 时间: 2024-1-21 14:34
Amber Tools 可以处理的，可以参照教程《非标准氨基酸残基的构建》，将乙酰化的残基视作非标残基即可。

作者
Author: 呆瓜 时间: 2024-1-21 23:18
gromacs就支持，把乙酰化后的氨基酸残基信息写入到rtp文件就可以了

作者
Author: 哼哼2001 时间: 2024-11-14 16:30
您的乙酰化修饰最终选择的什么方式添加的呀，我现在也遇到了这个问题。

作者
Author: 202422901008 时间: 2025-2-25 10:30

哼哼2001 发表于 2024-11-14 16:30
您的乙酰化修饰最终选择的什么方式添加的呀，我现在也遇到了这个问题。

您好，请问解决了吗，我也遇到了这个问题

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)