计算化学公社

标题: 高斯优化铱中心有机物催化胺硼烷体系脱氢中间体优化不出来 [打印本页]

作者
Author:
457503772    时间: 2024-1-18 08:43
标题: 高斯优化铱中心有机物催化胺硼烷体系脱氢中间体优化不出来
各位老师好,在用高斯16计算铱中心有机物催化胺硼烷体系脱氢时,按照以往文献存在的一个中间体始终优化不出来,直接优化到了最终产物,想请问有什么办法可以优化出来?
这个gjf文件是想要优化出的中间体的大概构型,log文件是多次尝试优化后一直是同一个构型(最终产物的构型)
log文件的原子坐标:
Ir                -0.22982800   -0.06718500   -0.13820900
C                  1.73916100   -0.43350900    0.03080900
C                  3.93567900   -0.87502500   -0.04415800
C                  3.57072600   -0.84323700    1.26590700
H                  4.89235400   -1.09212800   -0.49171300
H                  4.15070200   -1.01765700    2.15937400
N                  2.79778500   -0.61259700   -0.79273100
N                  2.22225400   -0.56892900    1.28349000
C                  1.31128500   -0.47173900    2.43504400
C                  1.90066800    0.49468200    3.46000200
H                  2.09435300    1.46008900    2.98334600
H                  1.18852600    0.63783800    4.27871000
H                  2.82806700    0.10636100    3.89822200
C                  1.15016000   -1.86534000    3.03877800
H                  2.11354000   -2.26668200    3.37259800
H                  0.48732800   -1.81847900    3.90854200
H                  0.72024000   -2.56032400    2.31328600
C                 -0.03684700    0.08257100    1.90028100
H                 -0.86237300   -0.43323500    2.39727700
H                 -0.10793200    1.14638700    2.14731300
C                  2.74704200   -0.65736300   -2.27517000
C                  1.49833300    0.06326800   -2.77806000
H                  1.51372600    0.06987000   -3.87265700
H                  0.57495200   -0.45698300   -2.48262400
H                  1.46761000    1.09765100   -2.42534000
C                  3.97670000    0.05890900   -2.83345800
H                  4.01236200    1.09345500   -2.47739500
H                  4.90994900   -0.44850500   -2.56946600
H                  3.91955300    0.07479300   -3.92553400
C                  2.72642600   -2.12584300   -2.69939000
H                  2.68852100   -2.20276000   -3.79049200
H                  3.62300700   -2.65046600   -2.35270100
H                  1.84947800   -2.63329800   -2.28438200
C                 -2.29358700   -0.03440900   -0.16633400
C                 -4.53813700    0.14362600   -0.19749100
C                 -4.24170000   -1.17315800   -0.08396100
H                 -5.49777200    0.62753800   -0.24785400
H                 -4.88879700   -2.03316300   -0.01632800
N                 -3.34180100    0.83502600   -0.25007200
N                 -2.87264900   -1.25815900   -0.07303900
C                 -3.24566600    2.31343800   -0.39648100
C                 -2.51457700    2.63481600   -1.70124600
H                 -1.51610200    2.19457000   -1.73461700
H                 -3.08148900    2.25078000   -2.55579800
H                 -2.41534300    3.71894000   -1.81324200
C                 -2.54571000    2.88949400    0.83502000
H                 -1.54782400    2.47328900    0.97239400
H                 -2.45727900    3.97579000    0.73356700
H                 -3.13081900    2.67460000    1.73533700
C                 -4.64636500    2.91887500   -0.47542000
H                 -5.22716600    2.73516100    0.43442100
H                 -4.54338900    4.00205300   -0.58441400
H                 -5.20586000    2.55413600   -1.34299000
C                 -2.06242500   -2.47585400    0.07277700
C                 -2.19288500   -2.97555700    1.51139500
H                 -1.83080900   -2.22993400    2.22320600
H                 -3.23603600   -3.20348800    1.75630700
H                 -1.60840300   -3.89188000    1.64150400
C                 -2.57444000   -3.54098200   -0.89633400
H                 -1.90931200   -4.40924600   -0.86064400
H                 -3.58192100   -3.88776800   -0.64020800
H                 -2.58744000   -3.15892400   -1.92239300
C                 -0.62051300   -2.07098200   -0.27187300
H                 -0.45343900   -2.29596900   -1.34236700
H                  0.07481800   -2.71762500    0.27459700
N                  4.28355500    2.53840600    0.55724200
H                  5.04791300    2.75260800   -0.08279000
H                  4.24024900    1.52173600    0.67267700
H                  4.51168600    2.94487200    1.46441100
B                  2.84603100    3.12600600   -0.01635500
H                  3.02788700    4.31817200   -0.15940600
H                  2.69428000    2.51953900   -1.06388700
H                 -0.21371300    1.73370100   -0.37450300
O                  1.84896600    2.76794600    0.98034700
H                  0.50560900    1.68906700    0.02380200
H                  1.55741300    3.55880600    1.44590700


作者
Author:
457503772    时间: 2024-1-18 09:44
泛函使用的是PBE0-D3BJ,使用了Lanl2dz赝势基组,6-31G(d)描述中心铱
作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-1-18 17:34
你的体系和文献体系都有哪些区别?
即使结构有少许变化,也可能会使得文献存在的一个中间体,对于你的体系不存在
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-1-19 02:58
457503772 发表于 2024-1-18 09:44
泛函使用的是PBE0-D3BJ,使用了Lanl2dz赝势基组,6-31G(d)描述中心铱

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

注意看此文
谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因
http://sobereva.com/678http://bbs.keinsci.com/thread-38911-1-1.html
最好先把文献里相同体系结果重复出来,确保计算没问题,再算你的体系,这样如果得不到中间体,更有信心说那个中间体可能本来就不存在
作者
Author:
457503772    时间: 2024-1-19 08:46
sobereva 发表于 2024-1-19 02:58
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

谢谢sob老师,第一次发帖没有注意这个问题很抱歉,下次一定会注意




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3