计算化学公社
标题:
求助:一个过渡态的寻找
[打印本页]
作者Author:
xia.1
时间:
2024-1-20 00:03
标题:
求助:一个过渡态的寻找
本帖最后由 xia.1 于 2024-1-20 00:04 编辑
目前已知反应物和产物的结构,想寻找图中黑色的一个过渡态的结构,尝试使用xtb对过渡态进行一个初步的寻找,但是直接生成产物了,这种情况应该怎么寻找这个过渡态呢?
(, 下载次数 Times of downloads: 4)
上传 Uploaded
点击下载Click to download
(, 下载次数 Times of downloads: 1)
上传 Uploaded
点击下载Click to download
作者Author:
-HMDS-
时间:
2024-1-20 08:07
一般情况下直接搭分子就可以,一般把产物结构成的键拉长1.5倍左右就差不多,如果还找不到的话可以考虑低精度下做一个柔性扫描,在能量曲线上面找一下过渡态结构。如果没记错的话xtb是个半经验的程序,过渡态它跑不出来也正常。
作者Author:
wzkchem5
时间:
2024-1-20 17:15
xtb虽然计算结构比较可靠,但能量不可靠,倾向于高估键能。所以xtb很可能把能垒很低的成键反应算成没有能垒
欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)
Powered by Discuz! X3.3