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标题: 求助Chimerax配体替换报错 [打印本页]

作者
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zhuyoucai    时间: 2024-1-20 12:08
标题: 求助Chimerax配体替换报错
各位老师好,目前本人在采用Chimerax中的配体替换功能,由于软件自带的配体库较少。所以我自己尝试在Chimerax自己搭配体,运行然后添加至personal library。但是每次swap liand的时候,他总是提醒我报错。
“LookupError: could not determine best path between 1 N -1.163865 -1.293959 -0.124850 and 2 N 1.261765 0.074861 0.156870

File "C:\Users\49347\AppData\Local\UCSF\ChimeraX\1.7\Python311\site-packages\AaronTools\geometry.py", line 2083, in shortest_path
raise LookupError(

See log for complete Python traceback.

不知道各位老师有没有遇到过这种情况,非常感谢!



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zhuyoucai    时间: 2024-1-20 12:10
我还尝试自己使用配体金属化合物在高斯优化完后,添加至SEQCROW个人库,也报错。
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sobereva    时间: 2024-1-20 22:57
直接用gview多省事,没看出有什么必要用ChimeraX
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zhuyoucai    时间: 2024-1-21 10:54
sobereva 发表于 2024-1-20 22:57
直接用gview多省事,没看出有什么必要用ChimeraX

老师,就是我一条路径有十几个结构,这个可以批量替换配体。




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