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标题: aNCl分析教程有不懂之处,纯小白求助大神 [打印本页]

作者
Author: 艾尔斯灿 时间: 2024-1-20 20:49
标题: aNCl分析教程有不懂之处,纯小白求助大神
本帖最后由艾尔斯灿于 2024-1-21 15:34 编辑

使用Multiwfn做aNCI分析图形化考察动态过程中的蛋白-配体间的相互作用 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)
这个是教程的链接
纯小白,0接触,实在是没看懂
按步骤生成.xyz文件.可是为什么我的.xyz文件原子数只有160,.而给的示例文件原子数有161
在Multiwfn中,正常的示例文件的是 H72 C53 N16 O18 S2 而我的是 H72 C52 N16 O18 S2 少了一个C
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作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-20 22:30
没有叫“多功能波函数”的东西，别给Multiwfn乱起名

这都是GROMACS、VMD基本使用常识，跟Multiwfn无关。删除仅有的一帧当然之后还得往同一个ID里载入轨迹，北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）里我都明确讲过

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注意语言表达清楚，“可是为什么我的.xyz文件只有160,180行.而给的示例文件有161,而且有16万行” 都不知道你说的160、180、161是什么东西

搞清楚xyz文件格式定义
谈谈记录化学体系结构的xyz文件
http://sobereva.com/477

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