计算化学公社

标题: 关于lammps+plumed的数据后处理问题 [打印本页]

作者
Author:
lue611    时间: 2024-1-22 11:35
标题: 关于lammps+plumed的数据后处理问题
本帖最后由 lue611 于 2024-1-22 12:15 编辑

各位老师好,用plumed+lammps做on the fly probability enhanced sampling,用了两个cv,怎么可以得到二维的自由能面(FES)如下图。FES_from_Reweighting.py这个脚本好像只能得到一维的?
相关链接https://www.plumed.org/doc-v2.9/ ... terclass-22-03.html
作者
Author:
zhitengcheer    时间: 2025-9-2 17:59
可以得到2维度啊,在--cv cv1, cv2就行
作者
Author:
ljh123    时间: 2025-9-25 23:10
本帖最后由 ljh123 于 2025-9-25 23:14 编辑

请问这个脚本能否用于元动力学的重加权?重加权的公式应该是一样的吧?
#####
仔细看了下教程,应该是可以的




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3