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标题: 使用MS中forcite模拟固液表面分子吸附，所有分子仅仅在原位振动，不发生吸附 [打印本页]

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Author: chaojichaoji 时间: 2024-1-22 12:45
标题: 使用MS中forcite模拟固液表面分子吸附，所有分子仅仅在原位振动，不发生吸附
如题，使用MS建立了如图所示的模型，两侧为氧化铁，中间层为含有COOH基团分子的溶液。COOH应该吸附在氧化铁表面才对。但是使用Forcite模拟了2ns之后所有的分子都在原地振动没有发生吸附，求教各位老师这种情况可能发生的原因，具体的模拟步骤如下：

1.使用AC模块建立溶液模型
2.对溶液盒子几何优化，300K-500K退火2ns
3.NPT 2ns控制密度
4.添加上下两层氧化铁分子
5.几何优化，300K-500K退火2ns
6.NVT分子动力学2ns

是没有添加真空层的原因吗，因为之前使用只有一侧氧化铁的模型计算时可以看到分子的吸附，如图2.

作者
Author: chaojichaoji 时间: 2024-1-22 12:46
两次模拟都对固体原子进行了固定

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-22 22:58

chaojichaoji 发表于 2024-1-22 12:46
两次模拟都对固体原子进行了固定

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

作者
Author: Qing-958 时间: 2024-7-3 14:52
请问您解决了吗？

作者
Author: 245 时间: 2024-8-31 10:51
解决了吗，怎么解决的，我的没有固定也是在自己的位置运动

作者
Author: maxqxy 时间: 2025-2-16 19:19

245 发表于 2024-8-31 10:51
解决了吗，怎么解决的，我的没有固定也是在自己的位置运动

请问你解决了吗

作者
Author: maxqxy 时间: 2025-2-16 19:19

Qing-958 发表于 2024-7-3 14:52
请问您解决了吗？

您解决了吗

作者
Author: maxqxy 时间: 2025-2-16 19:22
请问解决了吗

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