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标题: 求助使用gromacs进行分子动力学模拟怎样生成minim.mdp nvt.mdp文件呢 [打印本页]

作者
Author: @LWS 时间: 2024-1-24 09:26
标题: 求助使用gromacs进行分子动力学模拟怎样生成minim.mdp nvt.mdp文件呢
求助：使用gromacs进行分子动力学模拟怎样生成minim.mdp nvt.mdp文件呢

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-25 04:33
mdp文件都是自己手动编辑的。也可以根据现成的模板的mdp文件自己根据实际需要修改。mdp里的选项在手册里都有说明，手册看不懂的可以在论坛里问

北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）里有GROMACS非常系统全面的讲解，所有重要的mdp的用法都有具体说明，对于不同问题的模拟都给了全套输入文件，包括mdp，也给了适用于各种情况的模板mdp

作者
Author: @LWS 时间: 2024-1-25 09:31
好的十分感谢老师

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