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标题: 五氧化二钒表面上进行过氧化氢吸附的AIMD模拟时POSCAR设置问题 [打印本页]

作者
Author: XIEH 时间: 2024-1-24 12:10
标题: 五氧化二钒表面上进行过氧化氢吸附的AIMD模拟时POSCAR设置问题
在五氧化二钒的某个表面上进行过氧化氢吸附的AIMD模拟，那么这个结构的POSCAR怎么设置呢？

1. 全部放开，不固定原子
2. 放开表面的上两层原子以及过氧化氢分子，固定表面的下层原子
3. 固定所有表面原子，只放开过氧化氢分子

恳请大佬解惑一下

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-25 04:47
2

作者
Author: XIEH 时间: 2024-1-25 22:38

sobereva 发表于 2024-1-25 04:47
2

感谢社长

作者
Author: XIEH 时间: 2024-1-25 23:09

sobereva 发表于 2024-1-25 04:47
2

社长，想再请问一下，盒子大小一定要大到只使用一个gamma点吗？如果原子数不够多，增加K点数量行吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-26 03:14

XIEH 发表于 2024-1-25 23:09
社长，想再请问一下，盒子大小一定要大到只使用一个gamma点吗？如果原子数不够多，增加K点数量行吗？

做动力学盒子必须足够大，否则被吸附分子会与镜像存在明显虚假相互作用，以及表面结构变化特征可能被虚假的周期性所严重影响，导致吸附行为研究不合理。
在确定了盒子尺寸基础之上，再决定k点多少合适、是否可以只用gamma点。而不是先根据k点的多少来决定盒子，不要本末倒置。

作者
Author: XIEH 时间: 2024-1-26 10:26

sobereva 发表于 2024-1-26 03:14
做动力学盒子必须足够大，否则被吸附分子会与镜像存在明显虚假相互作用，以及表面结构变化特征可能被虚假 ...

非常感谢您的回复，

我浅显地理解一下：把一个过氧化氢分子放在盒子中间，使它距离每一个边界都是10 Å（或者多大的距离才足够远？），这样子相邻镜像的两个过氧化氢分子就相距20 Å，再对这个盒子做K点收敛性测试确定K点取值。
我这样理解对吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-27 03:55

XIEH 发表于 2024-1-26 10:26
非常感谢您的回复，

我浅显地理解一下：把一个过氧化氢分子放在盒子中间，使它距离每一个边界都是10 & ...

对
与镜像相距12-15埃一般就够了

作者
Author: XIEH 时间: 2024-2-2 17:02

sobereva 发表于 2024-1-27 03:55
对
与镜像相距12-15埃一般就够了

感谢！

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