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标题: qst2寻找过渡态求助 [打印本页]

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Lzw1281    时间: 2024-1-25 14:52
标题: qst2寻找过渡态求助
大家好 就是我现在已经有了反应物和产物 要寻找过渡态 首先我用了opt=ts找过渡态 但是试了挺多初猜结构都没有成功 然后我就尝试了opt=qst2 我先把反应物和产物都用了m062x/def2tzvp优化了 然后提取他们的坐标用opt=qst2找过渡态 然后也正常算了 出来一个过渡态 但是我检查之后发现并不是我要的结构 所以我想问一下可以认为这种情况可以判定为没有过渡态吗?或者说从反应物到产物并不是一个基元反应?

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mfdsrax2    时间: 2024-1-25 15:45
这个其实挺难下结论的,最好的办法就是参考类似的反应机理,然后用到你的反应中来。

因为找不到过渡态有可能是确实不存在过渡态,也有可能是你经验不足,初猜和真实过渡态差别太大。就凭你这两句话很难得出正确的结论。
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Lzw1281    时间: 2024-1-25 16:00
mfdsrax2 发表于 2024-1-25 15:45
这个其实挺难下结论的,最好的办法就是参考类似的反应机理,然后用到你的反应中来。

因为找不到过渡态有 ...

谢谢您的回答 那接下来我能做的除了继续用opt=ts来进行寻找还能做点啥其他有用的操作呢
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mfdsrax2    时间: 2024-1-25 16:02
Lzw1281 发表于 2024-1-25 16:00
谢谢您的回答 那接下来我能做的除了继续用opt=ts来进行寻找还能做点啥其他有用的操作呢

可以做柔性扫描,扫描键长键角二面角这些参数,选择能量最高点作为TS初猜
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Lzw1281    时间: 2024-1-25 16:17
mfdsrax2 发表于 2024-1-25 16:02
可以做柔性扫描,扫描键长键角二面角这些参数,选择能量最高点作为TS初猜

您好 我刚才看了一下我的那个结构 不知道该扫哪一个二面角 冒昧问一下 您可以赏眼帮看一下吗?
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mfdsrax2    时间: 2024-1-25 16:49
Lzw1281 发表于 2024-1-25 16:17
您好 我刚才看了一下我的那个结构 不知道该扫哪一个二面角 冒昧问一下 您可以赏眼帮看一下吗?

你得告诉我们你想找什么反应的过渡态
作者
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gauss98    时间: 2024-1-25 17:10
本帖最后由 gauss98 于 2024-1-25 17:28 编辑
Lzw1281 发表于 2024-1-25 16:17
您好 我刚才看了一下我的那个结构 不知道该扫哪一个二面角 冒昧问一下 您可以赏眼帮看一下吗?

你这个可以扫描键长
第一个结构出发逐渐缩短8-5距离
或者第二个结构逐渐缩短8-6距离
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Lzw1281    时间: 2024-1-25 18:59
mfdsrax2 发表于 2024-1-25 16:49
你得告诉我们你想找什么反应的过渡态

就是从结构1到结构2的过渡态
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Lzw1281    时间: 2024-1-25 19:03
gauss98 发表于 2024-1-25 17:10
你这个可以扫描键长
第一个结构出发逐渐缩短8-5距离
或者第二个结构逐渐缩短8-6距离

好的 谢谢您 我来试试看




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