计算化学公社

标题: 求助,请问为什么Gromacs 2022.6在使用GPU加速的时候,无法使用Nose-Hoover控温? [打印本页]

作者
Author:
ONTHEWAY    时间: 2024-1-26 10:23
标题: 求助,请问为什么Gromacs 2022.6在使用GPU加速的时候,无法使用Nose-Hoover控温?
您好,请问为什么我在使用Gromacs 2022.6进行模拟的时候(已进行预平衡模拟),使用-update gpu指令的时候,输出显示无法使用Nose-Hoover控温。不加-update gpu时,是可以正常进行模拟的。请问这是什么原因导致的,怎么解决。谢谢
(, 下载次数 Times of downloads: 11)

作者
Author:
naoki    时间: 2024-1-26 13:54
本帖最后由 naoki 于 2024-1-26 14:56 编辑

估计就是Nose-Hoover控温算法与update gpu模式不兼容
p.s. 网卡了之后发现连回三条,抱歉
作者
Author:
lmch    时间: 2024-1-26 14:17
Nose-Hoover控温算法不能使用-update gpu ,没啥特殊必要,用V-rescale
作者
Author:
ONTHEWAY    时间: 2024-1-26 15:27
lmch 发表于 2024-1-26 14:17
Nose-Hoover控温算法不能使用-update gpu ,没啥特殊必要,用V-rescale

哦哦好的 谢谢
作者
Author:
ONTHEWAY    时间: 2024-1-26 15:27
naoki 发表于 2024-1-26 13:54
估计就是Nose-Hoover控温算法与update gpu模式不兼容
p.s. 网卡了之后发现连回三条,抱歉

好的好的  谢谢
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-1-27 00:49
V-rescale几乎是目前最好的热浴,没有Nose-Hoover的震荡问题,而且同时适合平衡相和产生相,因此应当一律默认用V-rescale。Nose-Hoover热浴没有任何使用价值了。
作者
Author:
ONTHEWAY    时间: 2024-2-19 10:18
sobereva 发表于 2024-1-27 00:49
V-rescale几乎是目前最好的热浴,没有Nose-Hoover的震荡问题,而且同时适合平衡相和产生相,因此应当一律默 ...

好的 谢谢老师




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3