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标题: 在Ubuntu中使用Gaussian一开始就报错 [打印本页]

作者
Author: 一昔a 时间: 2024-1-26 18:27
标题: 在Ubuntu中使用Gaussian一开始就报错
本帖最后由一昔a 于 2024-1-26 18:57 编辑

我在按照教程配置好Gaussian之后进行运算出现以下错误：
lvxc@lvxc:~/gaussian$ g16 <interaction.gjf> interaction.out
Error: illegal instruction, illegal opcode
rax 000000000139c230, rbx 00007ffe25c11410, rcx 0000000000040000
rdx 0000000000000000, rsp 00007ffe25c0b448, rbp 00007ffe25c0b450
rsi 00007ffe25c0b418, rdi 0000000002d15d90, r8  0000000000000060
r9  00000000013827d0, r10 00007ffe25c11780, r11 00007ffe25c113e0
r12 0000000002baadf0, r13 0000000002d15d90, r14 00007ffe25c11780
r15 0000000002d15d90
  /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(+0x42520) [0x145931b74520]
  /home/lvxc/g16/l202.exe() [0x139c2da]
Aborted

然后，我按照社长博客里面说的输入了以下命令：
lvxc@lvxc:~/gaussian$ export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge
在继续运行后变成了以下错误
Error: segmentation violation
rax 0000000000000000, rbx ffffffffffffffff, rcx 0000148f87df475b
rdx 0000000000000000, rsp 00007fff5e7db228, rbp 00007fff5e7db7a0
rsi 000000000000000b, rdi 0000000000000039, r8  0000148d87da2000
r9  0000000000000401, r10 0000148f87dc4f60, r11 0000000000000206
r12 00007fff5e7db7e8, r13 0000000000000000, r14 0000000000000000
r15 00000000000003e6
  /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(+0x42520) [0x148f87df4520]
  /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(kill+0xb) [0x148f87df475b]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x679759]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x6991ba]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x71c20c]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x9c187b]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x9c0181]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x9bf2dd]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x79504a]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x456f14]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x450beb]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x450af4]
  /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(+0x29d90) [0x148f87ddbd90]
  /lib/x86_64-linux-gnu/libc.so.6(__libc_start_main+0x80) [0x148f87ddbe40]
  /home/lvxc/g16/l301.exe() [0x4509e9]
Aborted
我查了下说可能是内存、核心这些设置问题，但我检查了下设置的内存、核心都没有超出可以调用的范围。

我的CPU是AMD Ryzen 7 7735HS with Radeon Graphics，这个CPU是绝对无法运行Linux版本的Gaussian吗？感谢各位帮忙解惑。

作者
Author: hebrewsnabla 时间: 2024-1-26 18:34
看看高斯输出文件里面有没有报错。

作者
Author: 一昔a 时间: 2024-1-26 18:58

hebrewsnabla 发表于 2024-1-26 18:34
看看高斯输出文件里面有没有报错。

你好，out文件最后是这样：
Leave Link  202 at Fri Jan 26 18:20:38 2024, MaxMem=  1073741824 cpu:             0.0 elap:             0.0
(Enter /home/lvxc/g16/l301.exe)
Standard basis: 6-31G(d) (6D, 7F)
Ernie: Thresh=  0.10000D-02 Tol=  0.10000D-05 Strict=F.
There are 254 symmetry adapted cartesian basis functions of A symmetry.
There are 254 symmetry adapted basis functions of A symmetry.
254 basis functions, 544 primitive gaussians, 254 cartesian basis functions
70 alpha electrons    70 beta electrons
   nuclear repulsion energy    1368.0728576415 Hartrees.
IExCor= 4336 DFT=T Ex+Corr=M062X ExCW=0 ScaHFX=  0.540000
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000 ScalE2=  1.000000  1.000000
IRadAn=    5 IRanWt=    -1 IRanGd=          0 ICorTp=0 IEmpDi=141
NAtoms= 28 NActive= 28 NUniq= 28 SFac= 1.00D+00 NAtFMM= 60 NAOKFM=F Big=F
Integral buffers will be 131072 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
R6DS8: Unable to choose the S8 parameter, IExCor= 4336 IXCFnc= 55 ScaHFX=  0.540000 IDFTD=4
Error termination via Lnk1e in /home/lvxc/g16/l301.exe at Fri Jan 26 18:20:38 2024.
Job cpu time:    0 days  0 hours  0 minutes  0.4 seconds.
Elapsed time:    0 days  0 hours  0 minutes  0.1 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    6 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1
这个错误提示我是第一次见到，不清楚是什么意思。
原始文件放在附件里面了，您能帮忙看一下吗，不过都是一些很平常的设定，应该不会有错吧

作者
Author: hebrewsnabla 时间: 2024-1-26 19:00

一昔a 发表于 2024-1-26 18:58
你好，out文件最后是这样：
Leave Link 202 at Fri Jan 26 18:20:38 2024, MaxMem= 1073741824 cpu: ...

M06-2X没法用GD3BJ

作者
Author: 一昔a 时间: 2024-1-26 21:22

hebrewsnabla 发表于 2024-1-26 19:00
M06-2X没法用GD3BJ

感谢感谢，没想到是这种问题

，抱歉回的晚啦

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-27 00:33
把下文仔细看了
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210

作者
Author: 一昔a 时间: 2024-1-27 10:40

sobereva 发表于 2024-1-27 00:33
把下文仔细看了
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210

嗯嗯，感谢老师。

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