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标题: 磷酸酸催化水解酰胺的过渡态优化结果是否可信?梯度收敛,但是位移不收敛 [打印本页]

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Sui1999    时间: 2024-1-26 18:53
标题: 磷酸酸催化水解酰胺的过渡态优化结果是否可信?梯度收敛,但是位移不收敛
各位老师好,我在找一个关于磷酸酸催化水解酰胺的过渡态,之前优化的时候经常出现梯度收敛但是位移不收敛的情况,然后我现在把几个内坐标去掉再去优化,orca提示收敛,其中梯度收敛提示overachieved,但是位移并没有收敛,且最大位移是收敛限的2倍,不知结果是否可信,输出截图、去掉的内坐标和原子坐标如下。

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%geom
        Modify_internal
       {D 33 32 30 29 R}  #orca序号从0开始
      {D 38 34 33 36 R}
      {A 7 20 38 R}
      {B 7 29 A}
        End
End


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wzkchem5    时间: 2024-1-27 01:33
是可信的。因为收敛标准本来就不是所有NO都变成YES,有的收敛得很好的YES是可以弥补存在NO的不足的
作者
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Sui1999    时间: 2024-1-27 10:59
wzkchem5 发表于 2024-1-27 01:33
是可信的。因为收敛标准本来就不是所有NO都变成YES,有的收敛得很好的YES是可以弥补存在NO的不足的

好的,谢谢。
作者
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Sui1999    时间: 2024-1-27 11:07
wzkchem5 发表于 2024-1-27 01:33
是可信的。因为收敛标准本来就不是所有NO都变成YES,有的收敛得很好的YES是可以弥补存在NO的不足的

老师我还想问一下,水解的反应路径用单重态去计算合适吗,因为水是三重态能量最低,我有点担心计算的结果不可用。
作者
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ionexchangeC    时间: 2024-1-27 12:04
Sui1999 发表于 2024-1-27 11:07
老师我还想问一下,水解的反应路径用单重态去计算合适吗,因为水是三重态能量最低,我有点担心计算的结果 ...

谁告诉你水三重态能量最低,难道你可以用磁铁把水吸起来吗
作者
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Sui1999    时间: 2024-1-27 12:41
ionexchangeC 发表于 2024-1-27 12:04
谁告诉你水三重态能量最低,难道你可以用磁铁把水吸起来吗

不好意思老师,脑子抽了,想问氧化的,我还想搜索氧化的反应路径,自旋多重度设置成1合适吗。
作者
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wzkchem5    时间: 2024-1-27 17:16
Sui1999 发表于 2024-1-27 05:41
不好意思老师,脑子抽了,想问氧化的,我还想搜索氧化的反应路径,自旋多重度设置成1合适吗。

什么氧化成什么?
单知道是氧化的,不可能唯一确定自旋多重度。必须自己画共振式,由最优共振式以及Hund规则确定自旋多重度
作者
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Sui1999    时间: 2024-1-27 18:29
wzkchem5 发表于 2024-1-27 17:16
什么氧化成什么?
单知道是氧化的,不可能唯一确定自旋多重度。必须自己画共振式,由最优共振式以及Hund ...

我是要做苯并恶唑的氧化,但是反应路径还不确定,目前可以参考的是下图的噁唑的氧化,但是感觉旁边加个苯环的话对反应路径影响挺大的,感谢老师的回复,我琢磨一下。
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苯并恶唑结构
(, 下载次数 Times of downloads: 26)

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ionexchangeC    时间: 2024-1-27 19:43
Sui1999 发表于 2024-1-27 18:29
我是要做苯并恶唑的氧化,但是反应路径还不确定,目前可以参考的是下图的噁唑的氧化,但是感觉旁边加个苯 ...

通常参与环加成反应的氧分子都是单重态。但是在DFT计算中,氧分子可能是以一个自旋极化单重态的方式参与反应。
作者
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Sui1999    时间: 2024-1-27 19:55
ionexchangeC 发表于 2024-1-27 19:43
通常参与环加成反应的氧分子都是单重态。但是在DFT计算中,氧分子可能是以一个自旋极化单重态的方式参与 ...

感谢老师回复,我再研究一下。




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