计算化学公社

标题: 请问ESP得出的图像怎么转化成表格 [打印本页]

作者
Author: 艾尔斯灿 时间: 2024-1-26 23:16
标题: 请问ESP得出的图像怎么转化成表格
http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html
根据这个教程,我得到了下图这样的数据和这些文件
(, 下载次数 Times of downloads: 21) (, 下载次数 Times of downloads: 18)
我想进一步得到这样的的表格数据,我看了http://sobereva.com/196这篇教程,但是感觉缺少文件,教程说实话没看懂...
(, 下载次数 Times of downloads: 19)

作者
Author: sobereva 时间: 2024-1-27 01:07

我们可以查看一下不同静电势区间内分子表面积，这对于了解分子表面静电势的定量分布很有益。做法是在后处理菜单中依次输入
9
all  //考虑所有原子对应的范德华表面
-25,22  //统计范围。当前体系分子表面静电势范围为-20.60~18.41kcal/mol，这里将范围稍微扩大并取整数来定义范围
15  //将-25~22kcal/mol均匀分为15个区间获得表面积
3  //输入的单位为kcal/mol
立刻屏幕上就输出了不同静电势区间内的表面积，我们将Center这一列和Area这一列的数据分别从屏幕上拷下来（不会拷的读者见手册5.4节），并粘贴到诸如Origin等作图工具里并作成条形图，就可以得到诸如以下图像

http://sobereva.com/196说得超级明白，哪里看不懂？

作者
Author: 艾尔斯灿 时间: 2024-1-27 09:35

sobereva 发表于 2024-1-27 01:07
http://sobereva.com/196说得超级明白，哪里看不懂？

这应该是载入哪个文件呢?

作者
Author: 乐平 时间: 2024-1-27 10:51

艾尔斯灿发表于 2024-1-27 09:35
这应该是载入哪个文件呢?

跟你得到静电势表面图一样的文件， .fchk 就行

流程也基本一致，先导入 .fchk 文件
再 12 Quantitative analysis of molecular surface
然后 0 Start analysis now!
接下来 9 Output surface area in specific value range of mapped function

后面就是社长在 2 楼回复你的内容

作者
Author: 艾尔斯灿 时间: 2024-1-27 11:43

乐平发表于 2024-1-27 10:51
跟你得到静电势表面图一样的文件， .fchk 就行

流程也基本一致，先导入 .fchk 文件

谢谢

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