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标题: 求助: amber如何在特定的PH环境下模拟分子对接的结果 [打印本页]

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Author: nakanosora 时间: 2024-1-28 12:57
标题: 求助: amber如何在特定的PH环境下模拟分子对接的结果
本帖最后由 nakanosora 于 2024-2-28 21:41 编辑

amber想要模拟特定PH条件下的蛋白和配体，需要怎么处理？

看到有个教程说是只需要改相应的氨基酸的马甲。
比如想模拟PH=5的条件，就把ASP改为AS4，GLU改为GL4。

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那是不是做分子对接前就要先把名字改了，还是做完分子对接后改马甲？

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