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标题: GROMACS的gmx current指令计算聚合物静态介电常数是否合理? [打印本页]

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liu840397562    时间: 2024-1-30 23:00
标题: GROMACS的gmx current指令计算聚合物静态介电常数是否合理?
请问老师同学们,有无使用gromacs做一些聚合物的介电常数模拟的,为何我通过gmx current指令计算聚合物介电常数总是只得到了1.1多或1.2多的介电常数,这与实际差距极大(正常应为3~4),据了解gromacs的计算公式和MS应该一致,均为如下图所示,但MS得到的结果却合理很多,均有~3接近实际,因此有如下问题:
1. 这难道只是由于GAFF和CompassII力场引起的巨大差异?
2. 难道是计算时候要在加电场的条件下模拟?(我没加电场...)
请各位老师同学赐教。

作者
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Nkki    时间: 2024-6-24 12:13
同学你好,我也在计算聚合物的介电常数,能否和你交流学习一下
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Nkki    时间: 2024-6-24 12:14
Nkki 发表于 2024-6-24 12:13
同学你好,我也在计算聚合物的介电常数,能否和你交流学习一下

我用MS计算介电常数,也是用你上面提到的那个公式,得到的结果总是和别人差很多。




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