计算化学公社

标题: 求助：sobtop选择原子类型时报错 [打印本页]

作者
Author: MGRACE 时间: 2024-2-2 17:14
标题: 求助：sobtop选择原子类型时报错
只有选择（1）时不报错，选择（2）（3）（4）时会出现跟下图相似错误，sobtop在ubuntu系统下运行。 (, 下载次数 Times of downloads: 22) (, 下载次数 Times of downloads: 4)

作者
Author: 丁越 时间: 2024-2-2 21:03
你给atomtype程序添加可执行权限了么？

另外产生mol2文件的时候推荐用OpenBabel，它产生的mol2文件格式比较规范，产生完了最后拖到Gaussview中看一眼有没有问题。
格式转化执行命令：obabel inpfile -O outfile

作者
Author: sobereva 时间: 2024-2-3 06:14
载入文件时的路径不要出现~，这仅在shell里才认，程序里不认

作者
Author: MGRACE 时间: 2024-2-3 12:04

sobereva 发表于 2024-2-3 06:14
载入文件时的路径不要出现~，这仅在shell里才认，程序里不认

谢谢社长解决了

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)