计算化学公社

标题: 想请问如何实现相同模拟时间的xtc文件的拼接 [打印本页]

作者
Author:
maojunlong    时间: 2024-2-4 12:27
标题: 想请问如何实现相同模拟时间的xtc文件的拼接
想问问各位老师,如果我有十个xtc文件,它们的时间都是0-10ns的,是不是用trjcat并不能实现将十个叠加变成0-100ns的新xtc文件。有什么办法实现这样的拼接?

作者
Author:
mizu-bai    时间: 2024-2-4 12:41
试试 MDAnalysis
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-2-5 03:42
那不叫叠加而叫累加

gmx trjcat结合-cat选项就能实现。VMD也可以做到,依次把轨迹载入到同一个ID然后保存轨迹
作者
Author:
maojunlong    时间: 2024-2-7 10:32
mizu-bai 发表于 2024-2-4 12:41
试试 MDAnalysis

好的谢谢老师
作者
Author:
maojunlong    时间: 2024-2-7 10:33
sobereva 发表于 2024-2-5 03:42
那不叫叠加而叫累加

gmx trjcat结合-cat选项就能实现。VMD也可以做到,依次把轨迹载入到同一个ID然后保 ...

好的谢谢老师




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3