计算化学公社

标题: GROMACS中控温有限制的最大温度么？ [打印本页]

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2024-2-4 14:46
标题: GROMACS中控温有限制的最大温度么？
各位前辈好！
本人在使用GROMACS模拟一种分子的结晶过程，在持续升温的过程中是否需要加大压强呢？
因为温度一旦超过1500 K体系就崩溃了，可是这个晶体的熔融温度是在2000K左右.
所以我想，是不是需要使用更高的压强来控制呢？当前压强是1 bar，constraints = none，
退火设置如下：
annealing                   = single
annealing-npoints       = 4
annealing-time             = 0    5000 15000  25000
annealing-temp          = 300 2000 2000 300

作者
Author: sobereva 时间: 2024-2-5 03:45
“崩溃” 指代不明。既可能是诸如动力学不稳定导致的数值模拟层面的崩溃，也可能诸如体系气化之类物理层面的因素导致体系崩溃。要弄清楚崩溃的内在原因。对于动力学不稳定跑崩了的情况，应当通过减小步长等方式试图解决，高温模拟由于原子速度比低温时整体快得多，往往需要用更小步长保证动力学稳定性。

作者
Author: 社会主义小战士 时间: 2024-2-5 22:01

sobereva 发表于 2024-2-5 03:45
“崩溃” 指代不明。既可能是诸如动力学不稳定导致的数值模拟层面的崩溃，也可能诸如体系气化之类物理层面 ...

谢谢社长！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)