计算化学公社

标题: 关于out文件输出后的体系价态变化问题 [打印本页]

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johngu111    时间: 2024-2-9 18:38
标题: 关于out文件输出后的体系价态变化问题
各位老师新年好,我发现自己构建的水合镧系金属离子体系,优化收敛后打开out文件中显示的电荷及价态和初始gjf种设置的不一样是怎么回事呢?是这个体系是不能为+3价?

作者
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sobereva    时间: 2024-2-9 18:57
计算用的输入文件里gjf文件里实际净电荷写的几(不要叫价态,有歧义),Gaussian计算时净电荷就是多少,Gaussian不会随便变化这个。
作者
Author:
johngu111    时间: 2024-2-9 20:42
sobereva 发表于 2024-2-9 18:57
计算用的输入文件里gjf文件里实际净电荷写的几(不要叫价态,有歧义),Gaussian计算时净电荷就是多少,Gau ...

哦哦,也就是打开out文件里显示的跟自己当时输入的其实没什么关系是吗
作者
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ionexchangeC    时间: 2024-2-9 22:27
如果用大核赝势的话确实可能出现GaussView显示bug,对照输出文件的内容确保计算无误就可以无视
作者
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sobereva    时间: 2024-2-10 08:18
johngu111 发表于 2024-2-9 20:42
哦哦,也就是打开out文件里显示的跟自己当时输入的其实没什么关系是吗

感觉似乎你搞错了什么
直接上传压缩后的输入输出文件
作者
Author:
johngu111    时间: 2024-2-10 09:41
sobereva 发表于 2024-2-10 08:18
感觉似乎你搞错了什么
直接上传压缩后的输入输出文件

好的,麻烦老师帮忙看看

作者
Author:
johngu111    时间: 2024-2-10 09:42
ionexchangeC 发表于 2024-2-9 22:27
如果用大核赝势的话确实可能出现GaussView显示bug,对照输出文件的内容确保计算无误就可以无视

好的,谢谢,确实用了大核赝势
作者
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sobereva    时间: 2024-2-10 20:49
johngu111 发表于 2024-2-10 09:41
好的,麻烦老师帮忙看看

你的输出文件和你的输入文件根本不对应

输出文件开头部分显示的输入文件里的内容:
-----------
Ce3+optfreq
-----------
Symbolic Z-matrix:
Charge =  3 Multiplicity = 1
Ce                    0.04446  -0.00922  -0.14717
O                    -1.82322  -1.28246  -1.3462
O                     1.86278  -0.41132   1.63558
O                     0.93523   2.22071  -1.08976
O                    -1.9797   -0.79552   1.28622
O                     0.40229  -2.51601   0.12441

...

然而你上传的输入文件Ce是最后一个原子


当前计算用的净电荷就是3,这从输出文件里Charge=              3.0000 electrons这一行就能明白。别管gview怎么显示的,识别不对输出文件是常有的事

作者
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johngu111    时间: 2024-2-10 23:02
sobereva 发表于 2024-2-10 20:49
你的输出文件和你的输入文件根本不对应

输出文件开头部分显示的输入文件里的内容:

好的,明白了,谢谢sob老师,新年快乐!




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