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标题: 如何解决gromacs模拟水接触角润湿性严重不足的问题 [打印本页]

作者
Author: ZINCxxy 时间: 2024-2-10 22:22
标题: 如何解决gromacs模拟水接触角润湿性严重不足的问题
本帖最后由 ZINCxxy 于 2024-2-10 22:22 编辑

各位老师好，我在用gromacs做水的接触角的模拟。我的问题是水滴落在羟基化二氧化硅表面的接触角与文献上的数据相差很多。文献里模拟的羟基化二氧化硅接触角都是20度左右（如图2），我模拟的接触角却是80度左右(如图1），润湿性严重不足。羟基化二氧化硅拓扑文件是按照http://sobereva.com/soft/Sobtop/#ex9的方法生成的。以下是模拟的相关文件，希望老师可以在百忙之中抽出时间指导，谢谢！
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图1
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图2

作者
Author: sobereva 时间: 2024-2-11 07:26
主要跟slab和水的相互作用描述有关
对于水一定要用现成的水模型，不要用通用的拓扑文件产生工具产生。文献里水用什么模型你就用什么，要精确重复文献slab的原子用的参数也应当和文献严格相同。

作者
Author: ZINCxxy 时间: 2024-2-12 21:25

sobereva 发表于 2024-2-11 07:26
主要跟slab和水的相互作用描述有关
对于水一定要用现成的水模型，不要用通用的拓扑文件产生工具产生。文献 ...

好的，谢谢老师

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