计算化学公社

标题: Gaussian计算分子量在400~500之间使用超算需要什么配置,远程服务器怎么使用 [打印本页]

作者
Author:
Ace2333    时间: 2024-2-15 10:52
标题: Gaussian计算分子量在400~500之间使用超算需要什么配置,远程服务器怎么使用
本人需要做过渡态计算,分子量在400~500之间,想要使用服务器加快计算效率,但是初次使用服务器摸不到头脑,不知道要多大的核数和配置比较合适,而且听说超算系统都是Linux系统居多,不清楚做密度泛函计算跟windows操作有没有什么不同,希望知道的小伙伴们能够帮忙解答。另外在网上搜索到可以使用远程服务器,想知道远程服务器怎么使用,有没有好的适合量化计算远程服务器平台推荐一下,感谢帮助,祝大家新年快乐,科研顺利!

作者
Author:
Strange    时间: 2024-2-15 11:14
你用超算一般都是提交作业吧,你根据自己用的超算作业系统找下脚本就行。提交任务用ssh和ftp,我用的是MobaXterm。你这个分子量是真“分子量”还是原子数啊,分子量400-500那挺小的,随便算。原子数的话那就很大,DFT估计算的挺吃力的
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-2-15 12:24
绝对不要只说原子量。很难理解为什么总有初学者拿原子量说事
光说原子量有什么意义?一个Au的原子量顶将近200个H,然而高斯函数、基函数又根本不是200倍的关系,特别是使用赝势基组的时候。诸如def2-TZVP下,一个Au的高斯函数数目也就约10个H而已。

如果能说清楚体系化学组成最好。如果是一类分子,要描述成诸如“300-400个原子的普通有机分子”、“60-80个原子的碳团簇”等等

仔细把下文看了,了解点硬件配置的基本常识
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444

Linux下Gaussian怎么执行看
Gaussian的安装方法及运行时的相关问题
http://sobereva.com/439http://bbs.keinsci.com/thread-10814-1-1.html



作者
Author:
Ace2333    时间: 2024-2-16 13:37
sobereva 发表于 2024-2-15 12:24
绝对不要只说原子量。很难理解为什么总有初学者拿原子量说事
光说原子量有什么意义?一个Au的原子量顶将近 ...

谢谢老师指点
作者
Author:
niobium    时间: 2024-2-16 14:09
sobereva 发表于 2024-2-15 12:24
绝对不要只说原子量。很难理解为什么总有初学者拿原子量说事
光说原子量有什么意义?一个Au的原子量顶将近 ...

分子量是做实验的人喜欢用来衡量分子大小的手段。我每次跟做实验的人合作,都要解释一下。
作者
Author:
乐平    时间: 2024-2-17 11:20
Ace2333 发表于 2024-2-16 13:37
谢谢老师指点

你这…… 谢了之后还是没说自己要做什么……

又不是军工的,还需要保密?

可以不用具体到是什么分子,只需要说大致什么类型的(有机?有机固体?)含有什么元素(C, H, O, N, S, P, 卤素)?




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3