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标题: 闲扯高斯输入文件的扩展名 [打印本页]

作者
Author: bomsaude 时间: 2016-10-24 18:41
标题: 闲扯高斯输入文件的扩展名
本帖最后由 bomsaude 于 2016-10-24 10:46 编辑

昨天看到有网友说在服务器上提交高斯任务，把文件扩展名都由gjf改为com，还特意用脚本或命令来批量处理这些繁琐的工作。由于我没有用过服务器之类的计算过，就用自己的台式机或笔记本算过一些，请教这么改是由服务器决定的还是高斯版本决定的，亦或个人喜好这么做的？

对于高斯计算输入文件的扩展名Windows一般用默认gjf，Linux默认com，但Linux下在个人电脑下gjf完全没有问题。

没有考虑过扩展名gjf和com什么意思，前段时间看到有些人把扩展名写为gif，可能是认为Gaussian Input File，亦或动态图片用多了，亦或把gjf误看成了gif。

原先就感觉高斯输入文件只和内容有关，和扩展名无关，刚才用一个小分子在个人台式机上Ubuntu下试了以下扩展名，结果都是一样的，耗时也没有什么差别：

规规矩矩的：test.gjf test.com
感觉合理的：test.txt
充满个性的：test.gif
随心所欲的：test.abc test.xyz
不拘一格的： test.qwe

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Author: 冰释之川 时间: 2016-10-24 19:38
看到不拘一格的，我笑尿了

作者
Author: 978142355 时间: 2016-10-24 22:02
Linux系统下是与文件扩展名无关，Linux其实也没有扩展名的概念，加了扩展名只是为了让用户知道这是什么那是什么，比如加了.sh就差不多知道应该是个脚本，但有与没有都不影响结果，还是内容决定的。PS：LZ的文章写的太有趣了

作者
Author: 小范范1989 时间: 2016-10-24 22:06
我感觉gjf是gaussian job file吧？我是这么理解。

作者
Author: stecue 时间: 2016-10-24 22:56
Linux的Gaussian不考虑扩展名，只要是文本文件就没任何区别。你不用文件，直接从标准输入手敲也行。用"<"输入重定向也行。用管道把其他程序的标准输入重定向到Gaussian也行。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-10-25 07:18
扩展名随意，高斯根本不管。即便Linux下用户一般也都是习惯用.gjf后缀。估计是因为高斯自带的测试任务都是.com后缀，以及手册里偶尔用.com，才导致一些人用.com。
那个网友可能是用的脚本只处理.com文件。实际上他把相关脚本改一下就完了。

我很不喜欢.com当高斯输入文件扩展名，因为和DOS可执行文件扩展名重复：
https://en.wikipedia.org/wiki/COM_file

作者
Author: helpme 时间: 2016-10-25 10:15
用com确实很不好，因为com在windows下是可执行的，危险性相当于exe，
所以一些软件互传文件的时候可能会被报错（比如Foxmail可能会不允许用com文件做附件）。
----不过竟然还是习惯了linux下用com，不知何时养成的习惯。看来要改。

作者
Author: stecue 时间: 2016-10-29 04:55

helpme 发表于 2016-10-25 10:15
用com确实很不好，因为com在windows下是可执行的，危险性相当于exe，
所以一些软件互传文件的时候可能会被 ...

GaussView在Linux下默认就是.com。我印象里早期的高斯（Gaussian 98之前？）对于输入文件是Linux格式（\n是换行符）还是dos格式（\r\n是换行符）好像有要求，不同平台混用会执行不下去，必须用dos2unix和unix2dos转换一下，所以大概有必要区分Windows平台的.gjf/.out以及Linux/UNIX平台的.com/.log。当然现在不存在这个问题了。

作者
Author: wswrpd 时间: 2016-10-29 10:34
我们这服务器不知道设置了什么，gjf就是segmentation error，只能接受com的扩展名

作者
Author: pwzhou 时间: 2016-11-1 13:56

wswrpd 发表于 2016-10-29 10:34
我们这服务器不知道设置了什么，gjf就是segmentation error，只能接受com的扩展名

好奇怪的服务器

作者
Author: youyno 时间: 2016-11-7 09:44
我一直以为是gif，而不是gjf，所以我就纠结为何自己建的输入文件高斯view打不开

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