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标题: 如何用V(r)或者G(r)进行RDG分析 [打印本页]

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蜗蜗蜗我蜗    时间: 2024-2-19 12:22
标题: 如何用V(r)或者G(r)进行RDG分析
本帖最后由 蜗蜗蜗我蜗 于 2024-2-19 12:24 编辑

本人进行了有机分子dimer的RDG计算,space function是Sign(λ2)ρ,本来是想看他们之间的π-π相互作用的差别,但是后来发现差别不大。
看这篇文献:Electron density and its reduced density gradient in the study of π–π interactions
里面说用V(r) G(r)或者 K(r)对π-π interaction的可视化效果会更好一些。
但是具体怎么在Multiwfn里计算呢?
我Multiwfn用的不太熟

想问sob老师或者有无大神了解?

麻烦了!谢谢各位!!



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sobereva    时间: 2024-2-19 13:51
用Multiwfn主功能5,分别计算IGMH的delta-g_inter或RDG的cube文件,以及V或G或K的cube文件,然后按下文绘制后者对前者等值面着色图

基于Multiwfn产生的cube文件在VMD和GaussView中绘制填色等值面图的方法
http://sobereva.com/402http://bbs.keinsci.com/thread-7756-1-1.html

用下文的方法可能效果更好
使用Multiwfn做Hirshfeld surface分析直观展现分子晶体和复合物中的相互作用
http://sobereva.com/701http://bbs.keinsci.com/thread-43178-1-1.html


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蜗蜗蜗我蜗    时间: 2024-2-19 14:59
sobereva 发表于 2024-2-19 13:51
用Multiwfn主功能5,分别计算IGMH的delta-g_inter或RDG的cube文件,以及V或G或K的cube文件,然后按下文绘制 ...

谢谢sob老师!
(你是我的神)




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