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标题: Gromacs模拟蛋白配体复合物进行nvt预平衡过程时显示LINCS warning如何解决？ [打印本页]

作者
Author: 12313 时间: 2024-2-19 16:10
标题: Gromacs模拟蛋白配体复合物进行nvt预平衡过程时显示LINCS warning如何解决？
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Gromacs模拟蛋白配体复合物进行nvt预平衡过程时显示LINCS warning如何解决？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-2-19 16:55
都不知道配体长什么样，结构也不给
配体的拓扑文件明显莫名其妙，有机体系怎么那么多UFF原子类型，而且居然原子电荷都不设
仔细看http://sobereva.com/soft/Sobtop里面的例子和详细的描述搞清楚创建拓扑文件的逻辑

作者
Author: 12313 时间: 2024-2-19 17:29

sobereva 发表于 2024-2-19 16:55
都不知道配体长什么样，结构也不给
配体的拓扑文件明显莫名其妙，有机体系怎么那么多UFF原子类型，而且居 ...

好的，谢谢老师

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