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标题: cp2k在EPYC 7B12上的编译踩坑记录以及与官方apptainer版速度对比 [打印本页]
作者
Author: wwxxxxxx    时间: 2024-2-20 17:04
标题: cp2k在EPYC 7B12上的编译踩坑记录以及与官方apptainer版速度对比
服务器平台为双路EPYC 7B12，内存为16*32=128 G，系统为openSUSE leap 15.5。编译过程参考大佬的帖子http://bbs.keinsci.com/thread-19009-1-1.html。编译期间报错不断，最后发现问题出在指令集上，只要在编译时指定指令集即可。

在./install_cp2k_toolchain.sh 这一步上添加参数--target-cpu=core-avx2，完整参数为：

  1. <font size="3"><span lang="EN-US"> </span>./install_cp2k_toolchain.sh \
  2. --math-mode=mkl \                         #使用mkl 库
  3. --with-intelmpi=system \              #使用Intel MPI 库
  4. --with-scalapack=no \                    #不用装这个
  5. --target-cpu=core-avx2              #指定core-avx2指令集</font>
复制代码

其他的库按需安装，在脚本install_cp2k_toolchain.sh中有详细介绍，自行查看即可。
apptainer版使用命令apptainerpull docker://cp2k/cp2k:2024.1_mpich_generic_psmp获得。
以下是速度测试，使用了一个96原子的晶胞优化任务作为测试标准，使用 mpiexec -n 16 -genv OMP_NUM_THREADS=4 启动任务：

(, 下载次数 Times of downloads: 6)


差距还是很明显的，每个OT CG差大约0.1，当然这是个四舍五入后的近似结果，不过也足够说明问题了，更详细的测试有空再说。
最后欢迎大佬们分享自己的踩坑记录，给我等小白排排雷。


作者
Author: 乐平    时间: 2024-2-22 11:34
请问截图里左边和右边分别是什么版本的结果？

文字描述里也没说哪本版本谁快谁慢…… 只说了“差距明显”……
作者
Author: Eudaimonia    时间: 2024-2-22 22:35
16*32=128
作者
Author: wwxxxxxx    时间: 2024-2-23 09:02
乐平 发表于 2024-2-22 11:34
请问截图里左边和右边分别是什么版本的结果？

文字描述里也没说哪本版本谁快谁慢…… 只说了“差距明显 ...

不好意思，疏忽了，左边是apptainer，右边是自己编译的。。。。。。
作者
Author: wwxxxxxx    时间: 2024-2-23 09:03
Eudaimonia 发表于 2024-2-22 22:35
16*32=128

大意了，大意了，16*32=512（-..-）



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