计算化学公社

标题: 如何利用VMD正确观看激发态之间的密度差 [打印本页]

作者
Author: Ding-Ding 时间: 2024-2-23 13:16
标题: 如何利用VMD正确观看激发态之间的密度差
本帖最后由 Ding-Ding 于 2024-2-23 13:17 编辑

各位老师好，最近在参考《使用Multiwfn计算激发态之间的密度差（http://sobereva.com/429）》这篇博文时，我可以按照步骤在Multiwfn里面绘制激发态之间的密度差图。

但是我想通过Multiwfn生成cube文件时发现只能生成一个密度增加的.cub文件，密度减少的cube文件无法生成。

想问一下大家，如何能正确同时生成两个文件，之后才可以用在VMD软件中。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-2-23 18:41
创建一个专门显示负值等值面的rep

用下文的脚本最省事，正负值部分直接同时显示出来
在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法
http://sobereva.com/483（http://bbs.keinsci.com/thread-13329-1-1.html）

作者
Author: Ding-Ding 时间: 2024-2-23 19:41

sobereva 发表于 2024-2-23 18:41
创建一个专门显示负值等值面的rep

用下文的脚本最省事，正负值部分直接同时显示出来

谢谢sob老师，刚刚解决了

作者
Author: cySean 时间: 2024-10-24 20:01

sobereva 发表于 2024-2-23 18:41
创建一个专门显示负值等值面的rep

用下文的脚本最省事，正负值部分直接同时显示出来

Sob老师您好！我在阅读《在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法》（http://sobereva.com/483）后，完成了VMD所在目录菜单中各类脚本的设置，但是在VMD中输入“cub XX”时，VMD显示“cub”为无效的指令！重新尝试多次以后依旧存在该问题，还希望Sob老师指导！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-10-24 22:35

cySean 发表于 2024-10-24 20:01
Sob老师您好！我在阅读《在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法》（http://sobereva.com/ ...

脚本文件没放对位置，或者改完vmd.rc没重启VMD，或者vmd.rc没改对

作者
Author: cySean 时间: 2024-10-25 09:03

sobereva 发表于 2024-10-24 22:35
脚本文件没放对位置，或者改完vmd.rc没重启VMD，或者vmd.rc没改对

非常感谢Sob老师！现在已经解决了！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)