计算化学公社

标题: 对同一结构使用同一方法和基组优化，怎么调整分子结构能使IGM图H-bond作用更强？ [打印本页]

作者
Author: L228870573 时间: 2024-2-23 16:05
标题: 对同一结构使用同一方法和基组优化，怎么调整分子结构能使IGM图H-bond作用更强？
图1a：
(, 下载次数 Times of downloads: 32)
图1b：
(, 下载次数 Times of downloads: 30)
图2a：
(, 下载次数 Times of downloads: 31)

图2b： (, 下载次数 Times of downloads: 30)

图3： (, 下载次数 Times of downloads: 32)

图1a和图2a是同一结构，然后调整了分子间的摆放位置，使用gaussian在相同基组和方法下优化后均无虚频，得到的IGM散点图可以看到图1b中明显出现了蓝色H-bond峰，而图2b却没有出现，尝试调整了几次结构，效果均不明显，但我认为应该存在一种结构，呈现出的H-bond作用更强，我该如何调整分子间的结构能使IGM散点图中的蓝色H-bond峰更大些，得到类似图3这种效果？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-2-23 17:01
你为什么认为“应该存在一种结构，呈现出的H-bond作用更强”？先确定你为什么有这个认知，免得这个预设的结论是错的

作者
Author: sobereva 时间: 2024-2-23 19:39
如果你的体系和文献一样，照着文献的图尽可能去摆初猜结构然后优化。如果优化不出来原文的结构直接联系作者，参看下文
谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因
http://sobereva.com/678（http://bbs.keinsci.com/thread-38911-1-1.html）

如果和文献里的结构不一样，用genmer+molclus做三聚体构型搜索试图找到能量最低构型，结果是什么样就是什么样
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html
genmer：生成团簇初始构型结合molclus做团簇结构搜索的超便捷工具
http://bbs.keinsci.com/thread-2369-1-1.html

强烈建议用IGMH代替IGM
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621（http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html）

作者
Author: L228870573 时间: 2024-2-24 18:50

wzkchem5 发表于 2024-2-23 17:01
你为什么认为“应该存在一种结构，呈现出的H-bond作用更强”？先确定你为什么有这个认知，免得这个预设的结 ...

因为我已经试了四五次了，每次结果都不一样，所以我觉得会有一种结构H-bond作用更强。

作者
Author: L228870573 时间: 2024-2-24 18:52

sobereva 发表于 2024-2-23 19:39
如果你的体系和文献一样，照着文献的图尽可能去摆初猜结构然后优化。如果优化不出来原文的结构直接联系作者 ...

谢谢老师，非常非常感谢您！！！

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)