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标题: 求助：怎么用Networkview插件做蛋白残基的cross correlation图? [打印本页]

作者
Author: 灵芝5 时间: 2024-2-23 17:54
标题: 求助：怎么用Networkview插件做蛋白残基的cross correlation图?
老师，您好：

我想用VMD的插件networkview做一个蛋白质的残基相关性图。我参考network_tutorial教程计算出了蛋白残基的contact.dat文件，但是不知道什么软件可以用这个文件生成下面这种残基相互作用图？

请问怎么样可以把contact.dat文件转成残基相互作用图。

作者
Author: rpestana94 时间: 2024-2-24 01:08
I don't know how to use the .dat file but you can use R package bio3d which can reproduce this graph pretty easily

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