计算化学公社

标题: 如何编写计算蛋白-蛋白重原子在4埃米阈值下的接触次数随时间变化的.tcl脚本 [打印本页]

作者
Author:
mtpeng    时间: 2024-2-23 22:18
标题: 如何编写计算蛋白-蛋白重原子在4埃米阈值下的接触次数随时间变化的.tcl脚本
体系是两蛋白,经过Gromacs模拟后,是否有类似的计算两个分子在最近距离阈值下判定为接触后计算接触数目随时间变化的脚本?若有过计算此任务的朋友们劳烦提供脚本参考一下,无现成的脚本也烦请提供以下编写思路,谢谢。

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-2-23 23:06
gromacs自带了现成的,参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html)的ppt:

(, 下载次数 Times of downloads: 9)
作者
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mtpeng    时间: 2024-2-24 15:33
sobereva 发表于 2024-2-23 23:06
gromacs自带了现成的,参考北京科音分子动力学与GROMACS培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_con ...

好的,感谢老师指导。




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