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标题: 求助：模拟聚合物很多链跑出盒子整体显得结果并不理想的问题；退火温度生不上去问题 [打印本页]

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Author: MGRACE 时间: 2024-2-25 19:37
标题: 求助：模拟聚合物很多链跑出盒子整体显得结果并不理想的问题；退火温度生不上去问题
本帖最后由 MGRACE 于 2024-2-25 19:45 编辑

目前在模拟一种接枝两性离子聚合物，能量最小化后半各项异性退火模拟后进行密度，回转半径等指标判断达到了平衡。但还是存在部分真空区域，而且很多聚合物链条跑出盒子，跟看过的文献相比感觉很不理想。希望各位老师指导下怎么解决。还有一个问题就是之前尝试升温到1000k消除真空区为什么模拟时从起始300k只能升温到600k左右就崩溃了 (, 下载次数 Times of downloads: 3)

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Author: slxc920113 时间: 2024-2-25 22:26
聚合物那么长，跨盒子不是很正常吗？

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Author: Seyilaxa 时间: 2024-2-26 07:43
那不是真空区，是周期性边界条件下另一侧盒子外的部分。温度过高模拟崩溃正常

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Author: MGRACE 时间: 2024-2-26 10:43

slxc920113 发表于 2024-2-25 22:26
聚合物那么长，跨盒子不是很正常吗？

但是我看的很多聚合物模拟的链比我这个长的多，虽然也有跨盒子的部分但没我这个夸张（比如从文献里面截取的第三张图），我的很多链都竖起来跨过盒子所以感觉很不理想。

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Author: MGRACE 时间: 2024-2-26 10:55

Seyilaxa 发表于 2024-2-26 07:43
那不是真空区，是周期性边界条件下另一侧盒子外的部分。温度过高模拟崩溃正常

温度过高崩溃有什么好的解决办法么？想模仿一些文献里升温后降温的方法看看结果会不会好一些，尝试论坛里一些解决崩溃的方法后还是崩溃

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Author: Seyilaxa 时间: 2024-2-27 20:00

MGRACE 发表于 2024-2-26 10:55
温度过高崩溃有什么好的解决办法么？想模仿一些文献里升温后降温的方法看看结果会不会好一些，尝试论坛里 ...

没有必要不需要高温后降温，从你模拟结果来看显示完整分子和让分子都在盒子里不可兼得

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