计算化学公社

标题: sobEDA输入文件中使用赝势计算时报错 [打印本页]

作者
Author: CLJJ 时间: 2024-2-27 11:10
标题: sobEDA输入文件中使用赝势计算时报错
本帖最后由 CLJJ 于 2024-2-29 10:36 编辑

各位老师好，我最近在计算一个Am化合物的sobEDA，在输入文件中使用genecp关键词写入了ECP赝势，但是在计算时算几秒就会C掉，fragment1.out中的报错信息如下：
%chk=fragment1.chk
Route card not found.
Error termination via Lnk1e in /opt/apps/g16/l1.exe at Mon Feb 26 21:46:53 2024.

看起来好像是输入文件的问题（因为使用卢老师的算例就能正常计算，说明路径应该是对的）。
输入文件以及含有报错信息的输出文件已经上传，还请各位老师指教。
(, 下载次数 Times of downloads: 20) (, 下载次数 Times of downloads: 9)

作者
Author: sobereva 时间: 2024-2-28 06:51
sobEDA所有输入文件一起上传，否则没法测试

“C掉”语义不明

使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685（http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html）
上文提到的sobEDA教程文件包里(CO)5CrCH2是带赝势的例子，照着对比搞清楚原因

作者
Author: CLJJ 时间: 2024-2-28 10:35
本帖最后由 CLJJ 于 2024-2-28 10:45 编辑

sobereva 发表于 2024-2-28 06:51
sobEDA所有输入文件一起上传，否则没法测试

“C掉”语义不明

老师您好，我已经对比了您给出的算例，但是还是找不到原因，所有的输入文件已经重新上传，还请您帮忙看一下。

作者
Author: imasen 时间: 2024-2-28 13:32
你的Multiwfn好像没有成功调用，你直接把pbs前面那段包括环境变量设置的部分复制到sobEDA.sh脚本前面，直接提交这个sh脚本应该就没问题了。

作者
Author: CLJJ 时间: 2024-2-28 17:03

imasen 发表于 2024-2-28 13:32
你的Multiwfn好像没有成功调用，你直接把pbs前面那段包括环境变量设置的部分复制到sobEDA.sh脚本前面，直接 ...

谢谢同学的回复

我已经解决了软件调用的问题，但是还是会报相同的错误，应该还是输入文件有问题。

作者
Author: imasen 时间: 2024-2-28 17:59
本帖最后由 imasen 于 2024-2-29 10:32 编辑

CLJJ 发表于 2024-2-28 17:03
谢谢同学的回复我已经解决了软件调用的问题，但是还是会报相同的错误，应该还是输入文件有问题 ...

因为你现在fragment.gjf没有正确生成，所以调用Multiwfn这一步肯定有问题，你可以把/dev/null改成read.txt，看一下输出里Multiwfn有没有正常运行。
(, 下载次数 Times of downloads: 4)

作者
Author: CLJJ 时间: 2024-2-28 19:53

imasen 发表于 2024-2-28 17:59
因为你现在fragment.gjf没有正确生成，所以调用Multiwfn这一步肯定有问题，你可以把/def/null改成read.tx ...

同学我已经按你所说的修改，但是还是报错

，报错信息显示： Error: Unable to find the input file you specified in argument。

作者
Author: imasen 时间: 2024-2-28 23:21

CLJJ 发表于 2024-2-28 19:53
同学我已经按你所说的修改，但是还是报错，报错信息显示： Error: Unable to find the input file you ...

你的system拼成sysytem了

作者
Author: CLJJ 时间: 2024-2-29 10:25

imasen 发表于 2024-2-28 23:21
你的system拼成sysytem了

谢谢同学的回复！之前只检查了文件中的内容，但是没有检查文件的名字

下次不会了

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