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标题: 使用gaussian-xtb接口gau_xtb出现问题 [打印本页]

作者
Author: andycheng2026 时间: 2024-2-27 20:03
标题: 使用gaussian-xtb接口gau_xtb出现问题
gaussian为G16-A.03；xtb为6.6.1；gau_xtb为1.0.1
试运行接口自带的示例TS.gjf时出现以下报错：
External calculation of energy, first and second derivatives.
Running external command "./xtb.sh R"
      input file    "/home/a/g16/scratch/Gau-123180.EIn"
      output file    "/home/a/g16/scratch/Gau-123180.EOu"
      message file    "/home/a/g16/scratch/Gau-123180.EMs"
      fchk file       "/home/a/g16/scratch/Gau-123180.EFC"
      mat. el file    "/home/a/g16/scratch/Gau-123180.EUF"
Failed to open output file from external program.
Error termination via Lnk1e in /home/a/g16/l402.exe

在scratch文件夹中确实只找到Gau-123180.EIn。请问大家该如何解决?

作者
Author: 乐平 时间: 2024-2-27 20:34
最可能的是 xTB 版本太新了，格式早就不匹配

xTB 6.61 是 2023年8月发布的
gau_xtb 1.01 版是 2020 年发布的，Latest version：1.0.1 (Release date: 2020-Jul-5)

社长之前就抱怨过 xTB 格式经常变的问题，很可能 gau_xtb 已经不能正常联用新版的 xTB 了

作者
Author: andycheng2026 时间: 2024-2-27 23:10

乐平发表于 2024-2-27 20:34
最可能的是 xTB 版本太新了，格式早就不匹配

xTB 6.61 是 2023年8月发布的

原来如此，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-2-28 06:19
实测通过此接口，G16 C.02结合xtb 6.6.1没有任何问题
仔细照着博文的用法描述检查，搞不清楚就调试脚本
将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析
http://sobereva.com/421（http://bbs.keinsci.com/thread-10106-1-1.html）

博文写明了

注：经常有人问怎么用本文提供的接口联用不成功，还怀疑是本文的接口不支持较新版本的xtb。在此明确说明，本文的接口没任何问题，至少令G16 C.01结合xtb 6.5.1运行都没问题。遇到跑自己的任务失败时，起码先把本文提供的例子重复一遍，死活不成功的话，在读懂接口脚本的内容基础上，让脚本输出一些中间信息（比如脚本里用ls命令显示当前目录下的文件都有哪些、用cp命令将临时产生的文件复制出来然后人工进行检查），总能搞明白原因。另外也不要用一些稀奇古怪的运行环境。

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