计算化学公社

标题: 计算径向分布函数的问题 [打印本页]

作者
Author: wanzongliang 时间: 2024-2-28 09:13
标题: 计算径向分布函数的问题
本帖最后由 wanzongliang 于 2024-2-28 10:32 编辑

我用gromacs模拟一个大分子的带电基团和周围水的径向分布函数，但模拟的结果有些奇怪
使用的是oplsaa全原子力场，各进行了三百纳秒的NVT和NPT平衡，计算了如图所示的带电基团的CH3中的H和水中O的径向分布函数，所得的结果均如图片所示
请问各位老师遇到过这种问题吗（附上我的力场文件

作者
Author: sobereva 时间: 2024-2-29 00:19
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

谁知道你想问什么

作者
Author: wanzongliang 时间: 2024-2-29 09:15

sobereva 发表于 2024-2-29 00:19
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http:// ...

抱歉老师，我找到了是我设置的问题，感觉那个径向分布函数不像正常径向分布函数的样子所以来问一下

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