计算化学公社
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在npt和md中应该如何正确设置wall?
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作者Author:
gaochangcheng
时间:
2024-2-29 10:46
标题:
在npt和md中应该如何正确设置wall?
本帖最后由 gaochangcheng 于 2024-2-29 10:46 编辑
请问在npt和md中设置wall的时候,看手册上写的“
通常最好使用半各向同性的压力耦合,并将
x/y
压缩系数设置为
0
,否则表面积会发生变化”
那z方向的设置成正常的4.5e-5就可以了吗?按道理说,z方向上设墙了,Z方向肯定要变成不可压缩的,如果xy也不可压缩,那就变成nvt了,和npt就没关系了呀?以下是我的npt.mdp和md.mdp文件,请大佬帮我看看设置的对不对。
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