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标题: 主族有机分子进行单点能计算方法和基组的选择? [打印本页]

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ngaoo    时间: 2024-3-1 09:40
标题: 主族有机分子进行单点能计算方法和基组的选择?
老师,您好,我想对一个优化后的有机小分子进行单点能计算,请问M062X-D3/def2tzvp-SDD这个方法和基组可以使用吗?

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sobereva    时间: 2024-3-1 09:41
看Q11,补全信息
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html
作者
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ngaoo    时间: 2024-3-1 10:23
本帖最后由 ngaoo 于 2024-3-1 10:40 编辑
sobereva 发表于 2024-3-1 09:41
看Q11,补全信息
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva ...

老师,您在[size=1.28571em]绘制静电势着色的分子间范德华表面穿透图那篇博文里说,把复合物进行结构优化后将单体抠出来需要进行单点能计算。

复合物(两个分子复合)进行了#p opt B3LYP/6-311G** em=gd3bj优化,我将其中的一个分子L-脯氨酸分子(C5H9NO2)抠出来后,想在高斯上进行单点能计算,请问可以根据这个M06-2X-D3/def2-TZVP级别来算吗?


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shenghan0303    时间: 2024-3-1 16:27
ngaoo 发表于 2024-3-1 10:23
老师,您在绘制静电势着色的分子间范德华表面穿透图那篇博文里说,把复合物进行结构优化后将 ...

完全可以,甚至可以稍微再精度高一点
作者
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ngaoo    时间: 2024-3-1 16:42
shenghan0303 发表于 2024-3-1 16:27
完全可以,甚至可以稍微再精度高一点

老师,你帮我看下这个gjf为什么一直说输入行有错误
%chk=D:\9.15fen-zi\Dan-Dian-Neng--example\L-P.chk
#p M06-2X-D3/def2-TZVP nosymm

xx

0 1
坐标忽略下
作者
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ngaoo    时间: 2024-3-1 16:44
shenghan0303 发表于 2024-3-1 16:27
完全可以,甚至可以稍微再精度高一点

精度高点的泛函wB97M-V是不是也可以,基组def2-TZVPP是不是也行
作者
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zh7729    时间: 2024-3-1 16:54
ngaoo 发表于 2024-3-1 16:42
老师,你帮我看下这个gjf为什么一直说输入行有错误
%chk=D:\9.15fen-zi\Dan-Dian-Neng--example\L-P.chk ...

方法基组定义的格式不对,试试#p M062X/def2TZVP em=gd3 nosymm
作者
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ngaoo    时间: 2024-3-1 16:59
zh7729 发表于 2024-3-1 16:54
方法基组定义的格式不对,试试#p M062X/def2TZVP em=gd3 nosymm

您说的对,为什么我那个就不行呢,这两个是一个方法吗
作者
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zh7729    时间: 2024-3-1 17:05
ngaoo 发表于 2024-3-1 16:59
您说的对,为什么我那个就不行呢,这两个是一个方法吗

是同一个
输入行的方法和基组必须要有正确的格式才可以被gaussian读取,比如M06-2X方法要写成M062X,def2-TZVP方法要写成def2TZVP,D3色散校正要单独写到后面
作者
Author:
ngaoo    时间: 2024-3-1 17:10
zh7729 发表于 2024-3-1 17:05
是同一个
输入行的方法和基组必须要有正确的格式才可以被gaussian读取,比如M06-2X方法要写成M062X,def ...

好的,谢谢您
作者
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sobereva    时间: 2024-3-2 06:25
ngaoo 发表于 2024-3-1 16:42
老师,你帮我看下这个gjf为什么一直说输入行有错误
%chk=D:\9.15fen-zi\Dan-Dian-Neng--example\L-P.chk ...

关键词一定要照着手册写,别随意发挥

并且看此文
DFT-D色散校正的使用
http://sobereva.com/210

Gaussian不支持wB97M-V




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