计算化学公社

标题: 求助gromacs能量最小化报错文件匹配，怎么解决呢 [打印本页]

作者
Author: @LWS 时间: 2024-3-4 10:19
标题: 求助gromacs能量最小化报错文件匹配，怎么解决呢
执行命令gmx grompp -f nvt.mdp -c em.gro -r em.gro -p ben.top -o nvt.tpr报错如下图：

谢谢大家。

作者
Author: dzdhp 时间: 2024-3-4 10:56
提示不是很明显吗，你gro文件里面的的原子数跟top里面对不上

作者
Author: @LWS 时间: 2024-3-4 11:15
看见了。谢谢，但是我不知道怎么解决这个问题呢。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-4 12:10
别自己在标题里手写[GROMACS]这种标签，这次给你改了，以后注意

检查top里的[molecules]字段，必须和gro文件里各类分子数、顺序都对应

作者
Author: @LWS 时间: 2024-3-5 15:00
好的，谢谢老师。

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