计算化学公社
标题:
MS蛋白质建模后转化data文件的问题
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作者Author:
prove
时间:
2024-3-4 20:02
标题:
MS蛋白质建模后转化data文件的问题
各位老师,我是想将我gromacs的amber 99 sb力场中的itp文件的参数对应到in文件中,我使用的是msi2lmp将pdb文件转换为data文件。然后自行将itp文件中的力场参数写入in文件的方法。我遇到了以下两个问题:
1.使用msi2lmp转换时,我在ms中给模型添加的是cvff力场,得到的data文件里的原子类型和itp文件中的原子类型呼应不了;
2.itp文件中的不同参数的单位是什么,在哪里可以找到呢?
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