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标题: GAMESS计算EDA输入文件问题 [打印本页]

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Author: morningya 时间: 2024-3-5 09:50
标题: GAMESS计算EDA输入文件问题
各位老师好，在用GAMESS算EDA的时候，我想算下图上下两个结构的相互作用能，分为两个片段应该怎么编辑呢？
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我现在尝试写了$LMOEDA MATOM(1)=10 1 MCHARG(1)=0 1 SUPBAS=.F. edatyp=gks $END
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但是无法读取这一行，请问正确的输入文件应该怎么写呢？
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作者
Author: paramecium86 时间: 2024-3-5 10:33
本帖最后由 paramecium86 于 2024-3-5 10:34 编辑

使用的GAMESS有没有重新编译过？GKS-EDA需要去厦大网站下载XEDA，然后patch一下原始的gamess，然后再重新编译把XEDA编译进GAMESS才可以用。或者直接使用他们的在线平台也可直接做GKS-EDA

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Author: sobereva 时间: 2024-3-5 10:37
如果你有Linux版Gaussian的话，推荐用sobEDA，输入文件非常好写，计算还非常快
使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685（http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html）

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Author: morningya 时间: 2024-3-5 10:54

sobereva 发表于 2024-3-5 10:37
如果你有Linux版Gaussian的话，推荐用sobEDA，输入文件非常好写，计算还非常快
使用sobEDA和sobEDAw方法做 ...

老师，我看您的帖子上面要求是G16,但是我们实验室高斯是09版本的，请问也可以用吗

作者
Author: morningya 时间: 2024-3-5 10:58

paramecium86 发表于 2024-3-5 10:33
使用的GAMESS有没有重新编译过？GKS-EDA需要去厦大网站下载XEDA，然后patch一下原始的gamess，然后再重新编 ...

我的是直接从GAMESS官网下载的然后找人安装的，意思是现在用不了GKS-EDA吗。因为我就是接触一下GAMESS的操作，对EDA类型没有要求，老师，如果我把edatyp=gks删掉能算吗

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Author: sobereva 时间: 2024-3-5 11:44

morningya 发表于 2024-3-5 10:54
老师，我看您的帖子上面要求是G16,但是我们实验室高斯是09版本的，请问也可以用吗

不一定会失败，可以实测。只能说G16肯定能行

作者
Author: zjxitcc 时间: 2024-3-5 13:22
本帖最后由 zjxitcc 于 2024-3-5 13:37 编辑

morningya 发表于 2024-3-5 10:58
我的是直接从GAMESS官网下载的然后找人安装的，意思是现在用不了GKS-EDA吗。因为我就是接触一下GAMESS的 ...

当然可以用，毫无问题。有了inp文件，既可以在自己机器上算，也可以到XACS云平台上算。完全不需要自己写inp文件（也不建议手写），基组和片段定义十分繁琐易错，GAMESS里一个基组名称可能并不对应Gaussian等常见程序中的常见基组。

只要是个正常人会点鼠标创建gjf文件即可：使用frag_guess_wfn小程序自动调用Gaussian做计算（g09/g16都支持）、产生GKS-EDA输入文件，内含写好的关键词、坐标、收敛好的轨道、片段和基组信息，提交给GAMESS后每个SCF计算可立即收敛，例子见https://jeanwsr.gitlab.io/mokit-doc-mdbook/chap5-3.html。

在GaussView里点Tools->Atom Groups即可划分片段。而且借助frag_guess_wfn小程序只需改变gjf文件中的EDA名称，即可进行多种EDA方法的计算，不需要记忆各种EDA方法的关键词和计算步骤，不需要关心哪个程序的SCF收敛性问题（因为产生的输入文件还含有收敛的轨道信息）。
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