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标题: Gromacs导出的rmsd坐标图如何修改横坐标Time的最大值？ [打印本页]

作者
Author: 12313 时间: 2024-3-5 09:52
标题: Gromacs导出的rmsd坐标图如何修改横坐标Time的最大值？
(, 下载次数 Times of downloads: 13) Gromacs导出的rmsd坐标图如何修改横坐标Time的最大值？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-5 10:39
这是具体作图程序的事
图像不是gromacs直接导出的

作者
Author: 12313 时间: 2024-3-5 17:20

sobereva 发表于 2024-3-5 10:39
这是具体作图程序的事
图像不是gromacs直接导出的

是这样老师，这里显示轨迹提取了200ps，该怎么做才能修改提取时间呢？

作者
Author: Medivan 时间: 2024-3-5 22:55
你跑了多长时间就能有多长时间的数据。如果你只跑了200ps那无论如何也只能有200ps。

如果要限定时间段请在gmx rms时灵活运用-b和-e参数

https://manual.gromacs.org/current/onlinehelp/gmx-rms.html

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-6 03:25

12313 发表于 2024-3-5 17:20
是这样老师，这里显示轨迹提取了200ps，该怎么做才能修改提取时间呢？

默认轨迹有多长就分析多长。
gmx里各种分析轨迹的工具都可以用-b和-e指定被分析的轨迹的起始和终止时间，显然不能超过实际跑了的时间范围

作者
Author: 12313 时间: 2024-3-6 21:28

sobereva 发表于 2024-3-6 03:25
默认轨迹有多长就分析多长。
gmx里各种分析轨迹的工具都可以用-b和-e指定被分析的轨迹的起始和终止时间 ...

谢谢老师

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