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标题: volmap计算SDF的isovalue值怎么选择 [打印本页]

作者
Author: ngaoo 时间: 2024-3-5 19:28
标题: volmap计算SDF的isovalue值怎么选择
本帖最后由 ngaoo 于 2024-3-5 20:42 编辑

老师，
1.我使用volmap得到了几个dx文件，其中部分文件载入到multiwfn转换为cub文件会闪退。

2. (, 下载次数 Times of downloads: 16) 老师，这个是我用volmap生成的，您之前的帖子说过isovalue太小会出现噪点，我这个是不是噪点？我只有将isovalue调整到0.03才会出现等值面，不知道这样合理吗？调整为其他数值的时候不会出现等值面。

3.不同的分子需要不同isovalue才会显示出来等值面，请问老师这样可以吗？比如A分子在isovalue=0.03，B分子在isovalue=0.06才会出现2图类似的区域。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-6 02:37
1 上传压缩后的dx文件，超过5MB就传网盘

2 没噪点。volmap经过高斯函数平滑后的不可能有噪点
没任何异常

3 横向对比需要统一。可以一张图里绘制不同isovalue的等值面，用不同的透明度

作者
Author: ngaoo 时间: 2024-3-6 14:11

sobereva 发表于 2024-3-6 02:37
1 上传压缩后的dx文件，超过5MB就传网盘

2 没噪点。volmap经过高斯函数平滑后的不可能有噪点

谢谢老师
我又重新生成了.dx文件，这次转换成功了。

作者
Author: 用户128668 时间: 2025-1-3 01:24

sobereva 发表于 2024-3-6 02:37
1 上传压缩后的dx文件，超过5MB就传网盘

2 没噪点。volmap经过高斯函数平滑后的不可能有噪点

老师您好，我想计算不同体系中的同种分子的SDF，等值面怎么选取呢？这个等值面的物理意义是什么呢？求解答

作者
Author: sobereva 时间: 2025-1-3 01:38

用户128668 发表于 2025-1-3 01:24
老师您好，我想计算不同体系中的同种分子的SDF，等值面怎么选取呢？这个等值面的物理意义是什么呢？求解 ...

Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

看上文Q63

作者
Author: 用户128668 时间: 2025-1-3 20:46

sobereva 发表于 2025-1-3 01:38
Multiwfn FAQ
http://sobereva.com/452

谢谢老师！

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