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标题: 求助gromacs中使用grompp指令在md中无法得到tpr文件,gromacs软件也不报错 [打印本页]

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不想延毕    时间: 2024-3-6 14:44
标题: 求助gromacs中使用grompp指令在md中无法得到tpr文件,gromacs软件也不报错
本帖最后由 不想延毕 于 2024-3-6 14:44 编辑

如图,利用charmm-gui建立的膜体系,在执行能量最小化以及nvt,npt的过程都能正常进行,在利用grompp命令整合参数时出现了这种情况,执行了几个步骤后就自动中断并让我重新输入命令,对应文件夹也没用生成tpr文件,gromacs也没有报错。想知道出了什么问题
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sobereva    时间: 2024-3-6 14:59
用linux版再试。Windows系统可以用vmware虚拟机装linux
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牧生    时间: 2024-3-6 15:05
考虑把中文路径改成全英文,且没有空格,没有符号的路径
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不想延毕    时间: 2024-3-6 16:00
牧生 发表于 2024-3-6 15:05
考虑把中文路径改成全英文,且没有空格,没有符号的路径

改全英文路径也没有解决问题,准备试试linux系统
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不想延毕    时间: 2024-3-6 16:00
sobereva 发表于 2024-3-6 14:59
用linux版再试。Windows系统可以用vmware虚拟机装linux

谢谢sob佬,我去研究研究
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lyZhu    时间: 2024-10-20 21:46
你好,我遇到同样问题,解决方案如下:使用2018cpu版本来grompp,再回到2020gpu版本来计算即可。

tip:1。高版本能兼容低版本,但注意力场里的参数要同步到cpu版本中去。2.我cpu版本从未出现上述问题,但gpu版本屡屡出现grompp后无输出问题。




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