计算化学公社
标题:
求助:VMD读取Hirshfeld表面分析数据报错,等值面为黑色
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作者Author:
maaaym
时间:
2024-3-7 17:01
标题:
求助:VMD读取Hirshfeld表面分析数据报错,等值面为黑色
各位老师好:
本人计算小白,最近在尝试做HS分析,但总是有困扰。
根据社长发的帖子按部就班的操作
使用Multiwfn做Hirshfeld surface分析直观展现分子晶体和复合物中的相互作用 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)
Multiwfn用的是2020版本,VMD用的是1.9.3 windows版本
操作唯一不同是在Multiwfn输入0开始分析之后再输入1才有社长所说的两个重要信息
具体操作如社长录的视频为主
使用Multiwfn结合VMD绘制Hirshfeld surface图分析分子晶体中的弱相互作用_哔哩哔哩_bilibili
目前遇到的问题是:最后用VMD可视化的时候等值面大部分为红色,这样合理吗?
我个人觉得是红蓝颜色反了,导致现在蓝色区域电子密度较大,但我不会调。
然后分子外围还会有黑色网状的污点,不知是为何??
为什么我插入不了图片啊
附件也加不了
作者Author:
sobereva
时间:
2024-3-9 06:42
Multiwfn没有叫2020的版本
甭用老掉牙版本,何况博文都强调了
本文的读者请务必使用2024-Feb-16及以后更新的Multiwfn版本
我只回复Multiwfn最新版本的使用问题
别人怎么都能上传图片和附件?明显连置顶的社员必读贴都没好好看
作者Author:
maaaym
时间:
2024-3-11 14:48
好的sob老师,下次注意!
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