计算化学公社

标题: surfanalysis.pdb不能批量产生 [打印本页]

作者
Author: jifeng131381 时间: 2024-3-7 19:56
标题: surfanalysis.pdb不能批量产生
使用Multiwfn+VMD生成分子表面静电势极大值极小值图，想一次处理6个分子，density.cub、ESP.cub、mol.pdb、vtx.pdb都是6个，只有surfanalysis.pdb只有一个，下附我的截图
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问一下问题出在了哪里？
不胜感激

作者
Author: Qianmou2718 时间: 2024-3-7 21:11
因为Multiwfn导出的surfanalysis.pdb并没有重命名，所以会被覆盖只剩一个

作者
Author: 乐平 时间: 2024-3-8 00:46
本帖最后由乐平于 2024-3-8 00:50 编辑

每次看到这样的问题，我都忍不住要推荐钟成老师的脚本来调用 Multiwfn。链接如下

批量产生 cube 文件
http://bbs.keinsci.com/thread-18745-1-1.html

批量导入 cube 文件到 VMD 并批量生成高质量图片
http://bbs.keinsci.com/thread-18150-1-1.html

批量操作更方便，不需要手动去填那么长一串文本，完全不会因为 Multiwfn 不能自动重命名而产生文件被覆盖的情况，而且最终出的图也有更多风格可以选择，配色更丰富好看。

作者
Author: jifeng131381 时间: 2024-3-8 10:29

Qianmou2718 发表于 2024-3-7 21:11
因为Multiwfn导出的surfanalysis.pdb并没有重命名，所以会被覆盖只剩一个

问问如何重命名呢

作者
Author: sobereva 时间: 2024-3-8 11:50
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612（http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html）

仔细看此文，每次调用完了Multiwfn用操作系统的改名命令重命名导出的文件

作者
Author: Qianmou2718 时间: 2024-3-9 19:17

jifeng131381 发表于 2024-3-8 10:29
问问如何重命名呢

直接重命名，然后改写下vmd的脚本就好了

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